[ Skip to the content ]

Institute of Formal and Applied Linguistics Wiki


[ Back to the navigation ]

Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revision Previous revision
Next revision
Previous revision
Last revision Both sides next revision
treex:api-implementation [2016/01/08 00:09]
popel
treex:api-implementation [2016/01/08 19:27]
popel
Line 150: Line 150:
  
 === SORTED-CHILDREN === === SORTED-CHILDREN ===
-Děti se ukládají setříděně buď do pole, nebo do spojáku (tedy každý uzel má pointer _next_node, případně i obousměrně _prev_node). Buď se ukládají pravé a levé děti zvlášť, nebo se při vracení dětí s přepínačem ''add_self'' vloží jejich rodič na správnou pozici. Metoda ''descendants'' uloží potomky do pomocného pole (klasickým průchodem do hloubky) a pak dotřídí. Perl i Python mají sort optimalizovaný na předtříděné sekvence (každý trochu jinak, Perl asi o něco lépe než pythoní timsort, který bere jen sekvence začínající na indexu 2**k, ale pro naše krátké sekvence to je asi úplně jedno). Nejde to implementovat jako iterátor bez toho pomocného pole.+Děti se ukládají setříděně buď do pole, nebo do spojáku (tedy každý uzel má pointer _next_node, případně i obousměrně _prev_node). Buď se ukládají pravé a levé děti zvlášť, nebo se při vracení dětí s přepínačem ''add_self'' vloží jejich rodič na správnou pozici. Metoda ''descendants'' uloží potomky do pomocného pole (klasickým průchodem do hloubky) a pak dotřídí. Perl i Python mají sort optimalizovaný na předtříděné sekvence (každý trochu jinak, Perl asi o něco lépe než pythoní timsort, který bere jen sekvence začínající na indexu 2^k, ale pro naše krátké sekvence to je asi úplně jedno). Nejde to implementovat jako iterátor bez toho pomocného pole.
  
 === SORTED-CHILDREN + ALL-NODES === === SORTED-CHILDREN + ALL-NODES ===
Line 172: Line 172:
  
  
-===== Benchmark načítání CoNLL-U vPerlu ===== +===== Profiling načítání CoNLL-U v Perlu ===== 
-Načítám cs-ud-train-l.conllu (68 MB, 41k sentences, 0.8 MWords) .+Načítám cs-ud-train-l.conllu (68 MB, 41k sentences, 0.8 MWords). Časy v sekundách. Excl(usive) časy se sčítají, krom těch označených "x", což jsou pomocné (alternativní) experimenty.
  
- 0.479s while (<$fh>) {chomp;} +|excl.|incl.| code                                   | note| 
- 1.409s + split /t/, ale hodnoty se zahodí a neukládají do proměnných +0.5 | 0.5 | ''while (<$fh>) {chomp;}''             | načtení řádka po řádce | 
- 5.722s totéžale hodnoty atributů se uloží do proměnných (které se hned zahodí) +| 0.3 | 0.8 | ''$line eq "" or $line =~ /^#/''       | test prázdné řádky a komentáře | 
- 7.724s + uzly se vytvoří jako undefuloží do pole @nodeskteré se zahodívytváří se bundly +| 0.7 | 1.5 | ''split /\t/, $line''                  | split 9 atributů dle tabů | 
-10.917s nedělá se split ani rehang, všechny atributy jsou prázdný řetězecstromy ale mají uzly +| 4.3 | 5.8 | ''my ($id$form, $lemma,...) =''      | uložení těch hodnot do proměnných | 
-13.460s korektní načtení, netestují se cykly, nevolá se set_parent (ale zopakuje se jeho kód+|x3.9 |     | ''UD::Node->new(form=>$form,...)''     vytvoření 0.8M uzlů se stejnými atributytedy 200K uzlů za sekunduviz [[#Benchmark konstruktorů v Perlu|následující benchmark]]| 
-15.903s korektní načtení, netestují se cykly, volá se set_parent($parent, {cycles=>'no-check'}) +| 4.5 |10.3 | ''UD::Node->new(form=>$form,...)''     | vytvoření 0.8M uzlů ze skutečných dat| 
-16.646s korektní načtení, testují se cykly, volá se set_parent($parent) +|x0.4 |10.7 | ''push @all_nodes, $node''             | uzly se ukládají do pole| 
-26.666s původní implementace načítání, kde se uzly vytvářejí pomocí $root->create_child a převěšují se pak z kořene na skutečného rodiče a děti jsou pole +| 1.9 |12.2 | ''weaken($node->{_parent}=$root)...''  | uzly se ukládají do dokumentu, věší se na kořenpřidávají do jeho seznamu dětí| 
-19.029s totéž, ale bez převěšování, tedy vše visí na kořenu+| 1.2 |13.4 | ''weaken($node->{_parent}=$parent)...''| uzly se věší na skutečného rodiče (v druhém průchodu, pomocné pole ''@parents'')| 
 +| 2.5 |15.9 | ''set_parent($parent,{cycles=>'no-check'})'' | set_parent místo optimalizovaného kódu (který neřešil předchozího rodiče atd.)| 
 +| 0.7 |**16.6**| ''set_parent($parent)''                | testování cyklů | 
 +|10.0 |26.6 | ''$root->create_child...''             původní implementace, kde se uzly převěšují z kořene na skutečného rodiče a děti jsou pole|
  
-  * Původní implementace byla velmi neefektivní, protože se při převěšování z kořene musely uzly odebrat z pole dětí kořene, čili se muselo to pole překopírovat a zmenšit o jeden prvek a složitost byla kvadratická. Převěšení trvalo 7s. Kdyby byly děti implementované spojákem místo pole (to mám stále v plánu), tak to bude rychlejší, ale stejně je zbytečné při načítání CoNLL-U uzly dávat do spojáků dětí kořene, ze kterého vím, že je budu za chvíli odebírat. + 
-  * Ušetřil jsem 10stedy víc než 7sVolám ímo ''UD::Node->new(...)'' místo ''$root->create_child(...)''+  * Původní implementace byla velmi neefektivní, protože se při převěšování z kořene musely uzly odebrat z pole dětí kořene, čili se muselo to pole překopírovat a zmenšit o jeden prvek a složitost byla kvadratická. Samotné převěšení trvalo 7s (a ještě 3s asi kvůli ''$root->create_child(...)'' místo ''UD::Node->new(...)''). Kdyby byly děti implementované spojákem místo pole (to mám stále v plánu), tak to bude míň než 7s, ale stejně je zbytečné při načítání CoNLL-U uzly dávat do spojáků dětí kořene, ze kterého vím, že je budu za chvíli odebírat. 
-  * Ještě víc by šlo ušetřit vypuštěním testování cyklů v CoNLL-U závislostech (1sa optimalizací kódu set_parent bez volání této metody (další 2s). +  * Vypuštěním testování cyklů v CoNLL-závislostech se ušetří necelá sekundacož za to asi nestojí 
-  * Nyní se nejvíc času stráví samotným vytvářením uzlů (10.917s-0.479s). To musím ještě prozkoumat.+  * Optimalizací kódu set_parent bez volání této metody se jakoby ušetří 2.5s. 
 +  * Poměrně dost času (4.3s) zabere vytváření 9 proměnných ''$form, $lemma,...''. Nešikovné je, že ''UD::Node->new(form=>$form,...)'' se tyto proměnné zkopírují do hashe a ty původní vypadnou ze scope a musejí se odalokovat. Čili vytváření uzlu zabere skoro stejný čas (4.5s). 
 +  * Když jsem všechny uzly ukládal do pole, tak odalokování pole (s 0.8M uzlů) trvalo cca 1s. To jsem do profilingu nezahrnul, ale benchmark jsem musel ručně spouštět víckrát. 
 + 
 +===== Benchmark konstruktorů v Perlu ===== 
 +Kolik objektů (uzlů s 9 stringovými atributyse vytvoří za 1 sekundu: 
 +  MooseMut   4509 Moose bez __PACKAGE__->meta->make_immutable 
 +  Moose     65941 
 +  Moo       78156 
 +  ManualA   99508 Manual array-based object, konstruktor vytvoří hash, aby zjistil, které atributy byly zadány 
 +  ManualH  191911 Manual hash-based object 
 +  XSAccHp  197371 Class::XSAccessor ale sub new {my $c=shift; bless {@_}, $c;} 
 +  XSAccAs  224108 Class::XSAccessor::Array, new bez parametrů, třeba volat settery 
 +  XSAccH   235633 Class::XSAccessor { constructor => 'new'
 +  --- následující implementace mají konstruktory, které berou jen hodnoty atributů, nikoli jména, tedy musejí být zadané ve správném pořadí 
 +  XSAccAf  324620 Class::XSAccessor::Array, sub fastnew {my $c=shift; bless [@_], $c;} 
 +  ManualAf 333188 Manual array-based object, sub fastnew {my $c=shift; bless [@_], $c;}
  

[ Back to the navigation ] [ Back to the content ]