[ Skip to the content ]

Institute of Formal and Applied Linguistics Wiki


[ Back to the navigation ]

Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revision Previous revision
Next revision
Previous revision
Next revision Both sides next revision
grid [2007/09/24 03:59]
bojar nice a qsub, paralelni pristup ke sdilenym diskum
grid [2007/10/01 16:19]
novak -b
Line 18: Line 18:
  
 Jednou za život musíte provést [[Základní nastavení SGE]], abyste SGE mohli používat. Jednou za život musíte provést [[Základní nastavení SGE]], abyste SGE mohli používat.
 +
  
 ===== Ukázka užití SGE ===== ===== Ukázka užití SGE =====
Line 64: Line 65:
   # když chcete zrušit všechny své joby (rušit cizí nesmíte)   # když chcete zrušit všechny své joby (rušit cizí nesmíte)
 </code> </code>
 +
 +** V.N.: "qdel all" mi nefunguje, nahradil jsem za:**
 +   qdel "*"
  
  
Line 83: Line 87:
  
 ===== Triky a opentlení ===== ===== Triky a opentlení =====
 +
  
 ==== ~bojar/tools/qsubmit ==== ==== ~bojar/tools/qsubmit ====
Line 88: Line 93:
 qsubmit je jako qsub, ale příjemnější: qsubmit je jako qsub, ale příjemnější:
  
-  * nemusíte vyrábět skript, vyrobí ho sám+  * nemusíte vyrábět skript, vyrobí ho sám (pozn.: nemusíte vyrábět skript, když použijete přepínač ''-b y'')
   * nemusíte připisovat ''-cwd -j y -S /bin/bash''   * nemusíte připisovat ''-cwd -j y -S /bin/bash''
  
Line 102: Line 107:
  
 Pokud se nemýlím, není dovoleno použít ''qsub'' ve skriptu/programu, který je už přes ''qsub'' spuštěn. Pokud se nemýlím, není dovoleno použít ''qsub'' ve skriptu/programu, který je už přes ''qsub'' spuštěn.
 +
 +
  
 ==== Proměnné prostředí, nastavení vlastního prostředí ==== ==== Proměnné prostředí, nastavení vlastního prostředí ====
Line 108: Line 115:
  
 Zatím nevím přesně, které ze souborů ''.login'', ''.bashrc'' ap. SGE spouští, jestli vůbec nějaké. Naopak, experimentálně jsem ověřil, že ''qsub -S /bin/bash skript'' nenačte žádný z ''.bashrc'', ''.bash_profile'', ''.login'', ani ''.profile''. Zatím nevím přesně, které ze souborů ''.login'', ''.bashrc'' ap. SGE spouští, jestli vůbec nějaké. Naopak, experimentálně jsem ověřil, že ''qsub -S /bin/bash skript'' nenačte žádný z ''.bashrc'', ''.bash_profile'', ''.login'', ani ''.profile''.
 +
 +Z toho například také vyplývá, že bez ošetření se jako **Java** používá
 +
 +   java version "1.5.0"
 +   gij (GNU libgcj) version 4.1.2 20070502 (Red Hat 4.1.2-12)
 +
 +Pokud chcete submittovaný program pouštět ve svém oblíbeném prostředí (např. nastavení ''PATH''), musíte v obalujícím skriptu příslušné ''.bash*'' načíst. Vždy je ale bezpečnější všude psát plné cesty, než spoléhat na PATH.
  
 ==== Jiný shell ==== ==== Jiný shell ====

[ Back to the navigation ] [ Back to the content ]