Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

--- grid [2007/10/04 15:56]
stepanek file not found
+++ grid [2008/08/07 10:25]
novak
@@ Line 4: / Line 4: @@
   * lrc.ufal.hide.ms.mff.cuni.cz: hlava clusteru. To znamená, že neslouží k výpočtům, ale ke správě fronty výpočtů, které se odesílají na výpočetní stroje v clusteru. Na hlavě se nemají pouštět žádné náročné výpočty a naopak na ostatní stroje v clusteru se mají výpočty odesílat výhradně prostřednictvím hlavy. Hlava má 2 procesory Intel Pentium D 3 GHz a 1 GB paměti.
-  * fireball1 až 10 (na každém 4 procesory Intel Xeon 3 GHz, 16 GB paměti, Fedora 7)
+  * fireball1 až 10 (4xcore, 16 GB RAM, Fedora 7, 2 procesory Intel Xeon 3 GHz)
-  * tauri1 až 10 (na každém 4 procesory Intel Xeon 3 GHz, 16 GB paměti, Fedora 7)
+  * tauri1 až 10 (4xcore, 16 GB RAM, Fedora 7, 2 procesory Intel Xeon 3 GHz)
-  * orion1 až 10 (na každém 4 procesory Intel Xeon 2 GHz, 16 GB paměti, 12.9.2007 naplánovaná odstávka na reinstalaci)
+  * orion1 až 10 (4xcore, 16 GB RAM, Fedora 7, 2 procesory Intel Xeon 2 GHz)
-  * sol1 až 10 (na každém 4 procesory AMD Opteron Dual Core 2 GHz, 16 GB paměti, 12.9.2007 naplánovaná odstávka na reinstalaci)
+  * sol1 až 13 (4xcore, 16 GB RAM, Fedora 7, 2 procesory AMD Opteron Dual Core 2 GHz)
 Frontovací systém umožňuje:
@@ Line 18: / Line 18: @@
 Jednou za život musíte provést [[Základní nastavení SGE]], abyste SGE mohli používat.
@@ Line 62: / Line 63: @@
 qsub -S /bin/bash
   # když chcete, aby skript běžel v bashi
+qsub -V
+  # když chcete předat proměnné prostředí
 qdel all
   # když chcete zrušit všechny své joby (rušit cizí nesmíte)
@@ Line 68: / Line 71: @@
 ** V.N.: "qdel all" mi nefunguje, nahradil jsem za:**
    qdel "*"
@@ Line 85: / Line 89: @@
 Víc pravidel není.
+===== Slušné chování =====
+Pokud chci spouštět úlohy, které poběží dlouhou dobu (hodiny, dny), nepustím je všechny najednou, aby cluster mohli využívat i ostatní.
 ===== Triky a opentlení =====
 ==== ~bojar/tools/shell/qsubmit ====
@@ Line 96: / Line 101: @@
   * nemusíte vyrábět skript, vyrobí ho sám (pozn.: nemusíte vyrábět skript, když použijete přepínač ''-b y'')
   * nemusíte připisovat ''-cwd -j y -S /bin/bash''
 <code>
@@ Line 102: / Line 106: @@
 </code>
+==== ~zeman/bin/qsub.csh ====
+Podobná věc pro ''tcsh''. Pokud bychom chtěli použít přesměrování standardního vstupu a výstupu, musíme ho dát do uvozovek nebo apostrofů, protože jinak se o něm ''qsub.csh'' nedozví, do skriptu k odeslání to neopíše a naopak jeho standardní vstup a výstup bude přesměrován. V přesměrování i v případných dalších argumentech, kde se vyskytují cesty k souborům, je vhodné použít úplné cesty. Pozor také na to, aby šlo o soubory a složky viditelné z celé sítě (tedy ne ve vašem ''/mnt/h/tmp'', například).
+<code tcsh>setenv SCRIPTFILE /tmp/`basename $1`.$$.csh
+echo $* > $SCRIPTFILE
+echo $*
+echo qsub -cwd -V -S /bin/tcsh -m e $SCRIPTFILE
+qsub -cwd -V -S /bin/tcsh -m e $SCRIPTFILE
+qstat -u '*'
+rm $SCRIPTFILE</code>
+Příklad spuštění:
+<code>qsub.csh $PARSER/train.pl "< $cesta/${xx}train.csts > $cesta/${xx}.1.stat"</code>
+(Kdybych místo uvozovek použil apostrofy, nerozbalily by se mi proměnné. První argument (název skriptu) klidně mohl být v uvozovkách spolu s přesměrováním. Dal jsem ho ven jen proto, že potom ''qsub.csh'' podle něj pojmenuje job ve frontě.)
 ===== Časté a záludné problémy =====

[ Back to the navigation ] [ Back to the content ]

Institute of Formal and Applied Linguistics Wiki

Differences