Differences
This shows you the differences between two versions of the page.
Both sides previous revision Previous revision Next revision | Previous revision Next revision Both sides next revision | ||
grid [2008/10/31 16:06] bojar qrunblocks sbira vystupy |
grid [2010/03/28 14:26] zeman Jak zjistit, jaké zdroje jsem pro svou úlohu požadoval. |
||
---|---|---|---|
Line 3: | Line 3: | ||
Cluster (shluk) neboli grid (mříž, síť) je skupina počítačů, | Cluster (shluk) neboli grid (mříž, síť) je skupina počítačů, | ||
- | * lrc.ufal.hide.ms.mff.cuni.cz: | + | * lrc.ufal.hide.ms.mff.cuni.cz: |
- | * fireball1 až 10 (4xcore, | + | * fireball1 až 10 (4xcore, |
- | * tauri1 až 10 (4xcore, | + | * tauri1 až 10 (4xcore, |
- | * orion1 až 10 (4xcore, | + | * orion1 až 10 (4xcore, |
- | * sol1 až 13 (4xcore, 16 GB RAM, Fedora 7, 2 procesory AMD Opteron Dual Core 2 GHz) | + | * sol1 až 13 (4xcore, 16 GB RAM, Ubuntu 8.04, 2 procesory AMD Opteron Dual Core 2 GHz) |
Frontovací systém umožňuje: | Frontovací systém umožňuje: | ||
Line 18: | Line 18: | ||
Jednou za život musíte provést [[Základní nastavení SGE]], abyste SGE mohli používat. | Jednou za život musíte provést [[Základní nastavení SGE]], abyste SGE mohli používat. | ||
- | |||
- | |||
===== Ukázka užití SGE ===== | ===== Ukázka užití SGE ===== | ||
Line 26: | Line 24: | ||
< | < | ||
- | ssh lrc | + | ssh lrc-two |
# přihlašte se na hlavu clusteru | # přihlašte se na hlavu clusteru | ||
echo " | echo " | ||
Line 39: | Line 37: | ||
# Pořadí parametrů **je** důležité, | # Pořadí parametrů **je** důležité, | ||
qstat | qstat | ||
- | | + | qstat -u ' |
+ | | ||
# SGE chvíli čeká, než skript opravdu spustí. Pro malinké úlohy tedy SGE může představovat | # SGE chvíli čeká, než skript opravdu spustí. Pro malinké úlohy tedy SGE může představovat | ||
# zbytečné zpoždění. | # zbytečné zpoždění. | ||
+ | # -u ' | ||
cat skript.sh.oXXXXX | cat skript.sh.oXXXXX | ||
# vypište si výstup skriptu. XXXXX je ID jobu, které bylo přiděleno | # vypište si výstup skriptu. XXXXX je ID jobu, které bylo přiděleno | ||
Line 97: | Line 97: | ||
===== Triky a opentlení ===== | ===== Triky a opentlení ===== | ||
+ | |||
==== ~bojar/ | ==== ~bojar/ | ||
Line 109: | Line 110: | ||
</ | </ | ||
+ | lépe funguje '' | ||
==== ~zeman/ | ==== ~zeman/ | ||
Line 157: | Line 158: | ||
===== Časté a záludné problémy ===== | ===== Časté a záludné problémy ===== | ||
- | ==== Submitnutý job nesmí znovu submitovat ==== | ||
- | Pokud se nemýlím, není dovoleno použít '' | + | ==== Submitnutý job může znovu submitovat ==== |
+ | |||
+ | Danovy starší zkušenosti s clusterem PBS (nikoli SGE) říkaly, že tohle nejde. Ale jde to, aspoň u nás. Příkazy | ||
Line 220: | Line 222: | ||
</ | </ | ||
+ | ==== Jak zjistit, jaké zdroje jsem pro svou úlohu požadoval ==== | ||
- | + | < | |
+ | hard resource_list: | ||
+ | hard resource_list: | ||
+ | hard resource_list: | ||
+ | hard resource_list: | ||
+ | hard resource_list: | ||
+ | hard resource_list: | ||
===== Synchronizace úloh (v Perlu) ===== | ===== Synchronizace úloh (v Perlu) ===== | ||
Line 273: | Line 281: | ||
* Pokud '' | * Pokud '' | ||
* Celý příklad je k vidění v Czengu od V.N. | * Celý příklad je k vidění v Czengu od V.N. | ||
- |