[ Skip to the content ]

Institute of Formal and Applied Linguistics Wiki


[ Back to the navigation ]

Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revision Previous revision
Next revision
Previous revision
Next revision Both sides next revision
grid [2009/05/13 21:26]
stranak
grid [2010/03/28 14:21]
zeman Submitnutá úloha může znova submitovat.
Line 18: Line 18:
  
 Jednou za život musíte provést [[Základní nastavení SGE]], abyste SGE mohli používat. Jednou za život musíte provést [[Základní nastavení SGE]], abyste SGE mohli používat.
- 
- 
  
 ===== Ukázka užití SGE ===== ===== Ukázka užití SGE =====
Line 26: Line 24:
  
 <code> <code>
-ssh lrc+ssh lrc-two
   # přihlašte se na hlavu clusteru   # přihlašte se na hlavu clusteru
 echo "hostname; pwd" > skript.sh echo "hostname; pwd" > skript.sh
Line 39: Line 37:
   # Pořadí parametrů **je** důležité, co je za jménem skriptu, to se předává skriptu.   # Pořadí parametrů **je** důležité, co je za jménem skriptu, to se předává skriptu.
 qstat qstat
-  # Podívejme se, jaké úlohy běží.+qstat -u '*'  
 +  # Podívejme se, jaké vaše úlohy běží.
   # SGE chvíli čeká, než skript opravdu spustí. Pro malinké úlohy tedy SGE může představovat   # SGE chvíli čeká, než skript opravdu spustí. Pro malinké úlohy tedy SGE může představovat
   # zbytečné zpoždění.   # zbytečné zpoždění.
 +  # -u '*' ukáže úlohy všech uživatelů na clusteri
 cat skript.sh.oXXXXX cat skript.sh.oXXXXX
   # vypište si výstup skriptu. XXXXX je ID jobu, které bylo přiděleno   # vypište si výstup skriptu. XXXXX je ID jobu, které bylo přiděleno
Line 158: Line 158:
 ===== Časté a záludné problémy ===== ===== Časté a záludné problémy =====
  
-==== Submitnutý job nesmí znovu submitovat ==== 
  
-Pokud se nemýlímnení dovoleno použít ''qsub'' ve skriptu/programukterý je už přes ''qsub'' spuštěn.+==== Submitnutý job může znovu submitovat ==== 
 + 
 +Danovy starší zkušenosti s clusterem PBS (nikoli SGE) říkaly, že tohle nejde. Ale jde to, aspoň u nás. Příkazy ''qsub'' a spol. jsou kromě hlavy clusteru dostupné i na všech strojích clusterusamozřejmě pokud váš soubor ''.bashrc'', ''.cshrc'' apod. zajistí, že se i na nich provede inicializace prostředí SGE.
  
  

[ Back to the navigation ] [ Back to the content ]