[ Skip to the content ]

Institute of Formal and Applied Linguistics Wiki


[ Back to the navigation ]

Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revision Previous revision
Next revision
Previous revision
Next revision Both sides next revision
grid [2012/10/19 13:04]
dusek
grid [2017/09/26 11:53]
popel
Line 1: Line 1:
-====== Sun Grid Engine (SGE) ======+====== ÚFAL Grid Engine (LRC) ======
  
-Cluster (shluk) neboli grid (mříž, síť) je skupina počítačů, na kterých běží software pro automatické umístění vašeho výpočtu na dosud nevytížený stroj. Cluster na ÚFALu se nazývá LRC (Linguistic Research Cluster) a clustrovací software na něm je Sun Grid Engine. Do clusteru jsou zařazené tyto počítače:+LRC (Linguistic Research Cluster) is a name of ÚFAL's CPU computational cluster, which has (as of 2017/09) about 1600 CPU cores (115 servers + 2 submission heads), with a total 10 TiB of RAM. 
 + 
 +If you need GPU processing, see a special page about our [[:gpu|GPU cluster called DLL]]. 
 + 
 +Cluster (shluk) neboli grid (mříž, síť) je skupina počítačů, na kterých běží software pro automatické umístění vašeho výpočtu na dosud nevytížený stroj. Cluster na ÚFALu se nazývá LRC (Linguistic Research Cluster) a clustrovací software na něm je (Sun/Oracle/Son of) Grid Engine. Do clusteru jsou zařazené tyto počítače:
  
   * lrc.ufal.hide.ms.mff.cuni.cz: hlava clusteru. To znamená, že neslouží k výpočtům, ale ke správě fronty výpočtů, které se odesílají na výpočetní stroje v clusteru. Na hlavě se nemají pouštět žádné náročné výpočty a naopak na ostatní stroje v clusteru se mají výpočty odesílat výhradně prostřednictvím hlavy. Hlava má 2 procesory Intel Pentium D 3 GHz a 1 GB paměti. Ve skutečnosti existují hlavy dvě - lrc1 a lrc2, které sdílí IP adresu lrc.ufal.hide.ms.mff.cuni.cz. V případě výpadku jedné z hlav, přebírá kontrolu ta druhá.    * lrc.ufal.hide.ms.mff.cuni.cz: hlava clusteru. To znamená, že neslouží k výpočtům, ale ke správě fronty výpočtů, které se odesílají na výpočetní stroje v clusteru. Na hlavě se nemají pouštět žádné náročné výpočty a naopak na ostatní stroje v clusteru se mají výpočty odesílat výhradně prostřednictvím hlavy. Hlava má 2 procesory Intel Pentium D 3 GHz a 1 GB paměti. Ve skutečnosti existují hlavy dvě - lrc1 a lrc2, které sdílí IP adresu lrc.ufal.hide.ms.mff.cuni.cz. V případě výpadku jedné z hlav, přebírá kontrolu ta druhá. 
Line 10: Line 14:
 | fireball[1-10]          | 2xCore4 Intel Xeon 3 Ghz    | 32         | Ubuntu 10.04     | | fireball[1-10]          | 2xCore4 Intel Xeon 3 Ghz    | 32         | Ubuntu 10.04     |
 | hyperion[1-10]          | 2xCore2 Intel Xeon 3 Ghz    | 32         | Ubuntu 10.04     | | hyperion[1-10]          | 2xCore2 Intel Xeon 3 Ghz    | 32         | Ubuntu 10.04     |
-| lucifer[1-5           | 2xCore4 Intel Xeon 2.4 Ghz  | 128        | Ubuntu 10.04     |+| lucifer[1-10          | 2xCore4 Intel Xeon 2.4 Ghz  | 128        | Ubuntu 10.04     |
 | orion[1-10]             | 2xCore4 Intel Xeon 2 Ghz    | 32         | Ubuntu 10.04     | | orion[1-10]             | 2xCore4 Intel Xeon 2 Ghz    | 32         | Ubuntu 10.04     |
-| pandora[1-10]           | 2xCore2 Intel Xeon 2.6 Ghz  | 16         | Ubuntu 10.04     | 
-| sol[1-8,11-13]          | 2xCore4 AMD Opteron 2 Ghz   | 16         | Ubuntu 10.04     | 
 | tauri[1-10]             | 2xCore4 Intel Xeon 3 Ghz    | 32         | Ubuntu 10.04     | | tauri[1-10]             | 2xCore4 Intel Xeon 3 Ghz    | 32         | Ubuntu 10.04     |
 | cosmos                  | 4xCore2 Intel Xeon 2.93 Ghz | 256        | Ubuntu 10.04     | | cosmos                  | 4xCore2 Intel Xeon 2.93 Ghz | 256        | Ubuntu 10.04     |
 +| belzebub                | 8xCore4 Intel Xeon 2.90 Ghz | 256        | Ubuntu 10.04     |
 | iridium                 | 2xCore4 Intel Xeon 1.86 Ghz | 512        | Ubuntu 10.04     | | iridium                 | 2xCore4 Intel Xeon 1.86 Ghz | 512        | Ubuntu 10.04     |
 | twister[1,2]            | 2xCore4 Intel Xeon 2.4 Ghz  | 48         | Ubuntu 10.04     | | twister[1,2]            | 2xCore4 Intel Xeon 2.4 Ghz  | 48         | Ubuntu 10.04     |
      
 +Outside LRC cluster:
 +^ Jméno                   ^ CPU                         ^ RAM (GB)   ^ OS               ^
 +| pandora[1-10]           | 2xCore2 Intel Xeon 2.6 Ghz  | 16         | Ubuntu 10.04     |
 +| sol[1-8,11-13]          | 2xCore4 AMD Opteron 2 Ghz   | 16         | Ubuntu 10.04     |
 +
 +
 +**Pandora machines** are in a special cluster and queue **ms-guests.q** available for our colleagues from KSVI and for students of [[http://ufal.mff.cuni.cz/courses/npfl102|Data intensive computing]] (see the 2016 handouts if you missed the course).
 +**Sol machines** are for us - we can ssh there, submit jobs and also do computing (e.g. collecting statistics from the submitted jobs).
  
 Frontovací systém umožňuje: Frontovací systém umožňuje:
Line 89: Line 100:
  
   * Nespouštět úlohy ručně. (O ručně spuštěných úlohách SGE nemá informaci, klidně na daný uzel pošle ještě další úlohy z fronty.)   * Nespouštět úlohy ručně. (O ručně spuštěných úlohách SGE nemá informaci, klidně na daný uzel pošle ještě další úlohy z fronty.)
-    * Interaktivní shell se dá získat příkazem <code>qrsh</code> (kdy specifikujete požadavky na zdroje stejně jako u <code>qsub</code>)+    * Interaktivní shell se dá získat příkazem ''qrsh'' (přičemž specifikujete požadavky na zdroje stejně jako u ''qsub'')
  
 Další doporučení: Další doporučení:
Line 258: Line 269:
 hard resource_list:         mem_free=16g hard resource_list:         mem_free=16g
 hard resource_list:         mem_free=31g</code> hard resource_list:         mem_free=31g</code>
 +
 +==== Jak rezervovat více jader na stejném stroji pro 1 job ====
 +
 +<code>
 +qsub -pe smp <pocet jader>
 +</code>
  
 ===== Synchronizace úloh (v Perlu) ===== ===== Synchronizace úloh (v Perlu) =====

[ Back to the navigation ] [ Back to the content ]