This is an old revision of the document!
Table of Contents
This is an outdated “subpage” of grid. The relevant info is now copied at installation and this page can be deleted.
Základní nastavení SGE
Musíte zařídit, aby se vám po každém nalogování na počítače v clusteru správně nastavily proměnné prostředí, které jsou pro práci s clusterem potřeba (včetně úpravy PATH, abyste viděli nástroje jako qsub a qstat). Tento krok se liší podle toho, jaký používáte shell:
bash
Do svého ~/.bash_profile (nikoli ~/.bashrc, protože ten skript vypisuje komentáře) přidejte následující řádky:
. /net/projects/SGE/user/sge_profile # Sun Grid Engine variables set...
A pak se znovu nalogujte, aby se tyhle řádky taky provedly.
csh
Výše uvedený Milanův skript pro bash testuje, na kterém počítači v clusteru se nacházíte, a podle toho vás nasměruje na SGE balík zkompilovaný pro příslušnou architekturu. Naštěstí nyní máme hlavu clusteru, počítač lrc.ufal.hide, takže je možné, že stačí počítat s jeho architekturou. Zkusil jsem si do ~/.cshrc přidat následující řádek a zatím se zdá, že to bude fungovat:
source /net/projects/SGE/Intel_6.1u2/default/common/settings.csh
Po změně .cshrc není potřeba se přelogovat, stačí zavolat source ~/.cshrc.