Differences
This shows you the differences between two versions of the page.
Both sides previous revision Previous revision Next revision | Previous revision Next revision Both sides next revision | ||
grid [2011/06/27 11:17] ufal Aktualizace informací o výpočetním clusteru |
grid [2015/02/13 19:47] ufal +belzebub |
||
---|---|---|---|
Line 3: | Line 3: | ||
Cluster (shluk) neboli grid (mříž, síť) je skupina počítačů, | Cluster (shluk) neboli grid (mříž, síť) je skupina počítačů, | ||
- | * lrc.ufal.hide.ms.mff.cuni.cz: | + | * lrc.ufal.hide.ms.mff.cuni.cz: |
- | * V následující tabulce je uveden seznam výpočetních uzlů clusteru (aktuální k 27.6.2011): | + | * V následující tabulce je uveden seznam výpočetních uzlů clusteru (aktuální k 6.4.2012): |
^ Jméno | ^ Jméno | ||
Line 10: | Line 10: | ||
| fireball[1-10] | | fireball[1-10] | ||
| hyperion[1-10] | | hyperion[1-10] | ||
+ | | lucifer[1-5] | ||
| orion[1-10] | | orion[1-10] | ||
| pandora[1-10] | | pandora[1-10] | ||
| sol[1-8, | | sol[1-8, | ||
| tauri[1-10] | | tauri[1-10] | ||
+ | | cosmos | ||
+ | | belzebub | ||
+ | | iridium | ||
+ | | twister[1, | ||
| | ||
Line 31: | Line 36: | ||
< | < | ||
- | ssh lrc-two | + | ssh lrc2 |
# přihlašte se na hlavu clusteru | # přihlašte se na hlavu clusteru | ||
echo " | echo " | ||
Line 72: | Line 77: | ||
qsub -V | qsub -V | ||
# když chcete předat proměnné prostředí | # když chcete předat proměnné prostředí | ||
- | qdel all | + | qdel \* |
# když chcete zrušit všechny své joby (rušit cizí nesmíte) | # když chcete zrušit všechny své joby (rušit cizí nesmíte) | ||
</ | </ | ||
- | |||
- | ** V.N.: "qdel all" mi nefunguje, nahradil jsem za:** | ||
- | qdel " | ||
Line 88: | Line 90: | ||
* Nespouštět úlohy ručně. (O ručně spuštěných úlohách SGE nemá informaci, klidně na daný uzel pošle ještě další úlohy z fronty.) | * Nespouštět úlohy ručně. (O ručně spuštěných úlohách SGE nemá informaci, klidně na daný uzel pošle ještě další úlohy z fronty.) | ||
+ | * Interaktivní shell se dá získat příkazem '' | ||
Další doporučení: | Další doporučení: | ||
Line 94: | Line 97: | ||
* Uklízet po sobě lokální data, protože jinak si tam už nikdo nic užitečného nepustí. | * Uklízet po sobě lokální data, protože jinak si tam už nikdo nic užitečného nepustí. | ||
* Vyhnout se hodně divokému paralelnímu přístupu ke sdíleným diskům. NFS server to pak nepěkně zpomalí pro všechny. Distribuujte tedy i data. | * Vyhnout se hodně divokému paralelnímu přístupu ke sdíleným diskům. NFS server to pak nepěkně zpomalí pro všechny. Distribuujte tedy i data. | ||
- | * Informovat SGE, kolik paměti úloha žere, aby na strojích nedošla paměť: < | + | * Informovat SGE, kolik paměti úloha žere, aby na strojích nedošla paměť |
Line 162: | Line 165: | ||
Bez '' | Bez '' | ||
+ | |||
+ | ===== Monitorování úloh ===== | ||
+ | |||
+ | * '' | ||
+ | * '' | ||
+ | * ''/ | ||
+ | * ''/ | ||
+ | * ''/ | ||
+ | * mem_total: celkova pamet uzlu | ||
+ | * mem_free: tedy kolik je jeste volne pameti z pametove quoty uzlu | ||
+ | * act_mem_free: | ||
+ | * mem_used: kolik je pameti skutecne pouzito | ||
+ | * ''/ | ||
+ | * celkovy pocet jader, pocet vyuzitych jader | ||
+ | * celkova velikost RAM, kolik je ji fyzicky nepouzite, kolik je ji jeste nerezervovane | ||
+ | * po jednotlivych uzivatelich (zrovna pocitajicich) -- kolik jim bezi uloh, kolik jich maji ve fronte a kolik z nich je ve stavu hold | ||
+ | * '' | ||
+ | * [[https:// | ||
===== Časté a záludné problémy ===== | ===== Časté a záludné problémy ===== | ||
Line 238: | Line 259: | ||
hard resource_list: | hard resource_list: | ||
hard resource_list: | hard resource_list: | ||
+ | |||
+ | ==== Jak rezervovat více jader na stejném stroji pro 1 job ==== | ||
+ | |||
+ | < | ||
+ | qsub -pe smp <pocet jader> | ||
+ | </ | ||
===== Synchronizace úloh (v Perlu) ===== | ===== Synchronizace úloh (v Perlu) ===== |